KEGG Pathway（http://www.genome.jp/kegg/pathway.html）

KEGG是一个综合性的网站，由日本京都大学生物信息学中心的Kanehisa实验室于1995年建立，Pathway通路数据库是大家最为熟悉的、用的最多的一个，

常见于SCI文章中：

其实，除了信号通路外还有疾病、药物、小分子化合物等多个数据库，是最经典的数据库之一。

知名度：«««««

图片美观指数：«««

易用指数：«««

2.BioCarta Pathway（https://cgap.nci.nih.gov/Pathways/BioCarta_Pathways）

BioCarta Pathway是另外一个常用的数据库，数据库中的通路图是这个样子的：

知名度：««««

图片美观指数：««««

易用指数：«««

3. Reactome pathway（http://www.reactome.org/）

Reactome数据库偏重于生化反应，也包括了各种通路，在文章中出现频率也很高，我们看一下Reactome的结构。

这是通路图总览

假如我们想看神经退行性疾病（比如阿尔茨海默症AD）相关的通路或者分子，就分别双击左侧的Disease，Neurodegenerative Diseases，Deregulated CDK……in Alzheimer's disease models，选项如下：

在右侧就出现了通路图

单击左下角的Molecules就看到了具体的分子

知名度：««««

图片美观指数：«««

易用指数：«««

以上介绍的KEGG、Biocarta和Reactome是我们最常用的三大数据库，我们一般叫“通路三剑客”，知名度高，但是图片美观程度一般。

4. CST pathway （https://www.cellsignal.com/common/content/content.jsp?id=science-pathways）

这个是Cell Signaling Technology公司的，通路齐全且美观，所以很多实验室把通路图拿来当挂历用：

知名度：««««

图片美观指数：««««

易用指数：«««

5. Sabiosciences Pathway Central（http://www.sabiosciences.com/pathwaycentral.php）

Sabiosciences是Qiagen的子公司，其通路图也非常漂亮：